মাইক্রোবায়োলজি বিভাগের মূলমন্ত্র হল মেডিক্যাল মাইক্রোবায়োলজি এবং সংক্রামক রোগ সম্পর্কে শিক্ষার্থীদের অন্তর্ভুক্তিমূলক বৈজ্ঞানিক নির্দেশনা প্রদান করা। মাইক্রোবায়োলজি স্নাতক এবং স্নাতকোত্তর উভয় কোর্সে একটি পৃথক বিষয় হিসাবে অন্তর্ভুক্ত করা হয়। সিলেট এমএজি ওসমানী মেডিকেল কলেজের মাইক্রোবায়োলজি বিভাগটি প্রথম তলার উত্তর অংশে অবস্থিত এবং কলেজ ভবনের একই তলার প্রায় অর্ধেক জায়গা দখল করে আছে। এটি সমস্ত আপ-টু-ডেট সংস্থান এবং পরিষেবা সহ একটি স্বাধীন পূর্ণাঙ্গ বিভাগ।

বিভাগের দুটি বিভাগ রয়েছে যথা একাডেমিক এবং ল্যাবরেটরি বিভাগ। একাডেমিক বিভাগটি স্নাতক এমবিবিএস কোর্সের অবিচ্ছেদ্য অংশ এবং স্নাতকোত্তর এম.ফিল (মাইক্রোবায়োলজি), অন্যান্য এম.ফিল এমডি এমএস ডিসিপ্লিন বাংলাদেশ মেডিকেল অ্যান্ড ডেন্টাল কাউন্সিল (সরকারি নিয়ন্ত্রক সংস্থা) অনুমোদিত কোর্স পাঠ্যক্রম অনুসারে। পরীক্ষাগার অংশটি ব্যবহারিক প্রদর্শন এবং গবেষণা কাজের মতো একাডেমিক কার্যক্রমের পরিপূরক। এই বিভাগটি মূলত সংযুক্ত হাসপাতালের অভ্যন্তরীণ এবং বহিরঙ্গন রোগীদের বিভিন্ন মাইক্রোবায়োলজিকাল তদন্ত নিয়ে উদ্বেগযুক্ত।

কর্মরত শিক্ষকগণের তালিকাঃ